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超保守元件（UCE）探針

更新時間：2025-02-09

訪問量：2048

廠商性質(zhì)：生產(chǎn)廠家

生產(chǎn)地址：

簡要描述：

超保守元件（UCE）探針
UCE 是序列高度保守的基因組區(qū)域，在其側(cè)翼有很多可變序列。因為許多基因組區(qū)域在大的分類范圍內(nèi)共享，在新物種和非模式物種的研究方面，這些關(guān)鍵區(qū)域作為系統(tǒng)發(fā)育的理想目標(biāo)捕獲候選區(qū)域已被定義和開發(fā)。 Arbor Biosciences 為各種分類學(xué)類群提供一系列即用型 UCE 探針，包括脊椎動物、昆蟲和植物中鑒定出的類似的保守直系同源基因位點。

產(chǎn)品介紹：

超保守元件（UCE）探針

超保守元件（Ultra Conserved Elements, UCEs）是序列高度保守的基因組區(qū)域，在其側(cè)翼有很多可變序列。因為許多基因組區(qū)域在大的分類范圍內(nèi)共享，在新物種和非模式物種的研究方面，這些關(guān)鍵區(qū)域作為系統(tǒng)發(fā)育的理想目標(biāo)捕獲候選區(qū)域已被定義和開發(fā)。 Arbor Biosciences 為各種分類學(xué)類群提供一系列即用型 UCE 探針，包括脊椎動物、昆蟲和植物中鑒定出的類似的保守直系同源基因（ Conserved Orthologous, COS ）位點。

產(chǎn)品特點

預(yù)設(shè)計 - 由專家設(shè)計，可立即使用

結(jié)果經(jīng)驗證 - 被同行認(rèn)可的論文不斷增多

流水線分析 - 簡單、方便的數(shù)據(jù)分析

性價比高 - 多個遠(yuǎn)親類群使用一套探針集

完整的解決方案 - 試劑盒包括所有必要的試劑

應(yīng)用范圍廣 - 具有適用性高的通用 Panels

產(chǎn)品應(yīng)用

• 系統(tǒng)發(fā)生學(xué)

• 群體遺傳學(xué)

• 系統(tǒng)發(fā)生樹

• 側(cè)翼區(qū)捕獲

即用型 PANELS

脊椎動物 • 輻鰭魚類 0.5Kv1 • 鱸形目 1Kv1 • 骨鰾魚類 2.7Kv1 • 脊椎動物 2.5Kv1、5Kv1 和 5Kv2B

無脊椎動物 • 蛛形綱 1.1Kv1 • 蜘蛛目 2Kv1 • 鞘翅目 1.1Kv1 • 雙翅目 2.7Kv1 • 半翅目 2.7Kv1 • 膜翅目 1.5Kv1、2.5Kv2P、2.5Kv2A 和 2.5Kv2AB • 鱗翅目 1.3Kv1 • 新 panels 咨詢

產(chǎn)品列表

類別	產(chǎn)品名稱	產(chǎn)品詳情
輻鰭魚類	myBaits UCE Actinopterygians 0.5Kv1	含2001個探針(120mer)，可以富集輻鰭魚類中的 500個 UCE 位點
鱸形目	myBaits UCE Acanthomorph 1Kv1	含 2628個探針(120 mer)，可以富集鱸形目中的 1314個UCE 位點
骨鰾魚類	myBaits UCE Ostariophysan2.7Kv1	含 6737 個探針(120 mer)，可以富集骨鰾魚類中的 2708 個 UCE 位點
菊科	myBaits COS Compositae 1Kv1	含 9678 個探針(120 mer)，可以富集菊科中的 1061 個直系同源基因，可以富集>700個位點
脊椎動物	myBaits UCE Tetrapods 2.5Kv1	含2560個探針(120 mer)，可以富集脊椎動物中的 2386個UCE 位點，其中鳥類和爬行動物 2.2k，哺乳動物約1k
	myBaits UCE Tetrapods 5Kv1	含5472 個探針(120mer) ，可以富集脊椎動物中的 5060個 UCE位點，其中鳥類和爬行動物 4k，哺乳動物約2-3k，兩棲動物1k
	mvBaits Tetrapods 5Kv2B	該版本已經(jīng)針對化石或者糞便樣本做過優(yōu)化，探針的長度是80nt，與其他兩款的區(qū)別:與 5KV1 版本覆蓋物種基本相同，針對降解比較嚴(yán)重的樣本效果會更好
蛛形綱	mvBaits UCE Arachnida 1.1Kv1	含14799個探針(120mer)，可以富集蛛形綱(蜘蛛，螨蟲，蝎子，盲蜘蛛及其近親中的1120個 UCE 位點
蜘蛛目	myBaits UCE Spider 2Kv1	含15015個探針(120mer)，可以富集蜘蛛目中>2000個UCE位點
鞘翅目	myBaits UCE Coleoptera 1.1Kv1	含13674個探針(120mer)，可以富集鞘翅目中的 1172個 UCE 位點
雙翅目	myBaits UCE Diptera 2.7Kv1	含31328 個探針(120mer)，可以富集雙翅目中的 2711個 UCE 位點
半翅目	myBaits UCE Hemiptera 2.7Kv1	含 40207 個探針(120 mer)，可以富”集半翅目中的2731個UCE 位點
膜翅目	myBaits UCE Hymenoptera 1.5Kv1	含2749 個探針(120 mer)，可以富集膜翅目(螞蟻、蜜蜂、葉蜂和黃蜂)中的1510個UCE位點
	myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2P	HymV1的擴展版本，含 31829 個探針(120 mer)，可以富集膜翅目(螞蟻、蜜蜂、葉蜂和黃蜂)中的2590個UCE位點
	myBaits UCE Hvmenoptera 2.5Kv2A	Hym2.5Kv2P的子集，僅含螞蟻基因組探針9898個(120 mer)，可以富集 2524 個UCE 位點和 16個核基因外顯子區(qū)域(外顯子根據(jù)四種遠(yuǎn)緣螞蟻物種設(shè)計，共12個基因)
	myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2AB	Hym2.5Kv2P的子集，僅含螞蟻和蜜蜂基因組探針 9332個(120 mer)，可以富集 2545 個UCE 位點和 12個核基因外顯子區(qū)域(7個基因)
鱗翅目	myBaits Lepidoptera 1.3Kv1	含 14363 個探針(120 mer)，可以富集鱗翅目(蝴蝶、蛾類及其近緣物種)中1381個UCE位點
其他物種UCE可定制，詳情請聯(lián)系我們。現(xiàn)有定制案例：兩棲類、珊瑚等。

參考文獻(xiàn)

• B.C. Faircloth et al. (2015). Target enrichment of ultraconserved elements from arthropods provides a genomic perspective on relationships among Hymenoptera. Molecular Ecology Resources

• B.C. Faircloth et al. (2012). Ultraconserved Elements Anchor Thousands of Genetic Markers Spanning Multiple Evolutionary Timescales. Systematic Biology

• J.E. McCormack et al. (2016). Sequence capture of ultraconserved elements from bird museum specimens. Molecular Ecology Resources

• J. Starrett et al. (2017). High phylogenetic utility of an ultraconserved element probe set designed for Arachnida. Molecular Ecology Resources

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